Proje 5

Projenin Özeti

Anakinra (Kineret ®) anti-IL-1 ajan olarak en sık kullanılan biyolojik moleküldür (Dinarello ve ark. 2012; Emmi ve ark. 2018; Biondi-Zoccai ve ark. 2020). Proteinin amino ucuna eklenen ikinci bir metyonin sebebiyle doğal IL-1Ra molekülünden farklıdır(Drugbank Accession Number DB00026).  Yaklaşık 17,3 kDa ağırlığında olması nedeniyle günde en az 1 kez uygulama gerektirmektedir. Ömür boyu ilaç kullanılması gereken monogenik otoinflamatuvar hastalıklarda kompliyans sorunlarına neden olmakta ve yaşam kalitesini olumsuz etkilemektedir (Akash ve ark 2013).

 Koç Üniversitesi ve İstanbul Üniversitesi yürütülen iş birliği ile sonucu IL-1Ra proteinini değişik polimerlerle konjuge edilmesi tasarlanmıştır. Çeşitli hesaplamalı yöntemlerle IL-1Ra değişikliğe uğratılarak PEGilasyona uygun hale getirilmiştir. Bu sayede PEGile edilen IL-1Ra protein türevlerinin etki süresi uzatılmıştır. Bu başvuru kapsamında, ürettiğimiz, PEGile ettiğimiz IL-1Ra türevinin, PEGilasyon yönünden etkinliklerinin karşılaştırılmasına izin verebilecek alternatif IL-1Ra yapılarının tasarlanarak ve üretilmesi sağlanacaktır.

 Bu amaçla öncelikle hesaplamalı yöntemlerle IL-1Ra proteininin IL-1R1’e bağlanmasını engellemeyen ve PEGilasyonu kolaylaştırıcı olabilecek farklı amino asid değişiklikleri tasarlanacaktır. Ardından elimizde mevcut olan IL-1Ra plasmidinde in vitro koşullarda yapılacak nokta mutasyonlarla tasarlanan moleküllerin bakteride sentezi yapılacak ve saflaştırma sonrasında PEGilasyona hazır ürünler elde edilecektir. Elde edilen ürünler Koç Üniversitesi’nde yürütülen PEGilasyon çalışmalarına aktarılarak işbirliği sağlanacaktır.

Hedeflenen Proje Çıktısı ve Sonucu