Proje 1
Proje Adı
Mevcut Kütüphane Verileri ve In Siliko Tasarım İle Farklı Ağır Zincir Antikorlarının Sentezi, In Vitro Ortamda Ürünlerin Etkinliğinin Değerlendirilmesi ve Afinitelerinin Artırılması
Sorumlu APYK
Bezmialem Vakıf Üniversitesi
Stratejik Hedef Adı
Projenin Özeti
Projenin amacı hesaplamalı ve deneysel yöntemler kullanarak interlökin-1 reseptörüne (IL-1R) bağlanacak ağır zincir antikor parçası (VHH) elde etmektir. İkincil bir amaç ise elde edilen antikorların afinitelerini iyileştirmeyi sağlayacak pratik, hesaplı ve geniş amaçlı bir yöntem geliştirmektir. “Nanokor” (nanobody) olarak da adlandırılabilecek ağır zincir antikor parçaları, modüler yapılı proteinlerdir ve hedef moleküllerine CDR (complementarity determining region) adı verilen 3 ayrı bölgedeki amino asitler vasıtası ile bağlanırlar. Nanokorların bu modüler yapıları, herhangi bir proteine bağlanacak CDR dizilerinin hesaplamalı yöntemlerle tespit edilmesine, böylece bir hedef moleküle bağlanarak onun işlevini baskılayacak -ve dolayısıyla ilaç işlevi görecek- bir antikorun tasarımına imkan tanır. Bu antikorlar, aynı zamanda memeli immünoglobülin G (IgG) antikorlarına nazaran daha basit ve ufak oldukları için koli basili kültürü kullanılarak üretilebilir.
Hedeflenen Proje Çıktısı ve Sonucu
Proje sonucunda elde edilecek tek zincirli antikor parçaları, üretimlerini takiben klinik öncesi ve klinik deneylere tabi tutularak ilaç geliştirme süreçleri başlatılacaktır. Dolayısıyla elde en az bir adet özgün, patentlenebilir ilaç adayı olacaktır. İnterlökin-1 reseptörünün romatoid artrit, ailevi akdeniz ateşi (AAA) vb. inflamazom kaynaklı birçok hastalığa ek olarak Covid-19 gibi enflamatuvar yanıtı tetikleyen hastalıklarda rol oynaması sebebiyle geliştirilecek ilacın yüksek ticari potansiyeli olması beklenmektedir. Bunun yanı sıra geliştirilecek afinite iyileştirme platformu, bu projede elde edilecek ve interlökin-1 reseptör antagonisti olarak işlev yapacak tek zincirli antikor parçasının yanı sıra güdümlü evrim prensibiyle birçok proteinin afinitesinin veya işlevinin artırılmasında kullanılabilecektir. Böylece ilaç adayına ek olarak geniş kullanım alanına sahip, önemli ve özgün önemli bir teknoloji kazanılacaktır. Son olarak, elde edilen moleküller ve teknolojik gelişmeler hakemli, etki değeri yüksek uluslararası dergilerde yayınlanacak; projede çalışan araştırmacılar protein üretimi ve mühendisliği, biyolojik ilaç tasarımı ve geliştirmesi gibi önemli biyoteknoloji alanlarında uzmanlık kazanacaktır.
Proje Görselleri
Ekibimiz
